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原来没有梅花鹿栖息的绿岛，在60年代开始有人引进梅花鹿畜养，割茸出售，随後并发展为绿岛特有的养鹿事业，最兴盛时期为民国66年至72年间，全岛拥有二千头以上的梅花鹿。但在台湾的养鹿事业一窝蜂跟进，鹿茸价格大跌之後，养鹿变得不符合经济效益，养鹿人家纷纷将饲养的梅花鹿野放山林，己经在台湾本岛野外绝迹多年的梅花鹿，又在绿岛的山林间重觅生机。

数量仍属珍贵的梅花鹿，是绿岛所重视的生态资源之一，原本已设立一处区域为梅花鹿园区，可让游客们更亲近、了解梅花鹿的生态，但园区於2010年暂时休业，绿岛乡公所计划会再委外经营或是争取经费重整为博物馆，让游客们能再次地和梅花鹿亲近。若想一睹绿岛的梅花鹿，可在一些民宿业者或是当地居民家中看到被饲养的梅花鹿，又或者当地导游会带领大家夜游，也有机会遇见栖息山林间的梅花鹿喔！