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原來沒有梅花鹿棲息的綠島，在60年代開始有人引進梅花鹿畜養，割茸出售，隨後並發展為綠島特有的養鹿事業，最興盛時期為民國66年至72年間，全島擁有二千頭以上的梅花鹿。但在臺灣的養鹿事業一窩蜂跟進，鹿茸價格大跌之後，養鹿變得不符合經濟效益，養鹿人家紛紛將飼養的梅花鹿野放山林，己經在臺灣本島野外絕跡多年的梅花鹿，又在綠島的山林間重覓生機。

數量仍屬珍貴的梅花鹿，是綠島所重視的生態資源之一，原本已設立一處區域為梅花鹿園區，可讓遊客們更親近、了解梅花鹿的生態，但園區於2010年暫時休業，綠島鄉公所計劃會再委外經營或是爭取經費重整為博物館，讓遊客們能再次地和梅花鹿親近。若想一睹綠島的梅花鹿，可在一些民宿業者或是當地居民家中看到被飼養的梅花鹿，又或者當地導遊會帶領大家夜遊，也有機會遇見棲息山林間的梅花鹿喔！